La dégradation des déchets fermentescibles s’accompagne de la formation de biogaz, gaz à effet de serre, qui est une source de nuisances.
Ces biogaz sont captés par l'installation puis brûlés à 1200 °C par les torchères, éliminant ainsi, sans apport d’autres combustibles, tous polluants et molécules odorantes.
Cette technologie constitue un mode de traitement classique des biogaz présents sur la majorité des centres de stockage de déchets. Il s’agit de convertir le méthane en dioxyde de carbone.
Dès 1997, pour répondre et dépasser les exigences réglementaires liées à la protection de l’environnement, la Commune de Saint-Herblain et le District de l'Agglomération Nantaise innovent en favorisant la valorisation énergétique : le groupe électrogène fonctionnant au biogaz permet de répondre aux besoins électriques de l’ensemble des installations de dépollution du site. Aujourd'hui, ce groupe est arrêté car la production de biogaz nécessaire à son fonctionnement est devenue insuffisante.